Enquanto isso, Edward e o número 48 alcançam a parte mais profunda do quinto laboratório e o jovem alquimista descobre que o local é usado pelo exército para tentar recriar a pedra filosofal. Alphonse é feito de refém e ele tem que enfrentar um grande dilema quando sua moral é questionada por alguém de seu passado.
Ed e Al vão para o hospital, enquanto Winry chega a cidade Central para fazer os reparos nas próteses mecânicas.
Sentindo-se incomodado por sua própria existência, Al foge de Ed. Procurando pela verdade, ele conhece dois garotos que o levam até um acampamento, onde sobreviventes do massacre de Ishbal estão vivendo. Lá ele reencontra Scar. Subitamente o acampamento é atacado por uma gangue de mercenários, e assim Al se une a Scar para defender o povo.